Lima tahun setelah peristiwa di film pertama, Sister Irene (Taissa Farmiga) kembali berhadapan dengan Valak, demon nun yang mengerikan. Kali ini, Valak telah merasuki seorang gadis muda di sebuah sekolah asrama di Prancis. Irene dan seorang biarawati muda lainnya, Debra (Storm Reid), dikirim oleh Vatican untuk membantu exorcist setempat mengusir Valak dan menyelamatkan gadis itu.

Setibanya di sekolah asrama, Irene dan Debra menemukan bahwa tempat itu dihantui oleh roh-roh jahat. Mereka juga mengetahui bahwa Valak memiliki rencana yang lebih besar daripada hanya merasuki gadis itu. Valak ingin menghancurkan Gereja Katolik dari dalam, dan ia menggunakan sekolah asrama sebagai tempat untuk melancarkan serangannya.

Irene dan Debra harus berpacu dengan waktu untuk mengusir Valak sebelum ia dapat melaksanakan rencananya. Mereka dibantu oleh seorang buruh lokal bernama Frenchie (Jonas Bloquet) dan seorang guru sekolah asrama bernama Kate (Annabelle Wallis). Bersama-sama, mereka harus menghadapi Valak dan pasukan roh jahatnya untuk menyelamatkan gadis itu dan Gereja Katolik.